Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nphs1Q9QZS7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nphs1Q9QZS7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms