Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NumbQ9QZS3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NumbQ9QZS3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NumbQ9QZS3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms