Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb11Q9QY30 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abcb11Q9QY30 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcb11Q9QY30 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms