Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fscn3Q9QXW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fscn3Q9QXW4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fscn3Q9QXW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms