Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trip4Q9QXN3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trip4Q9QXN3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms