Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53inp1Q9QXE4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms