Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcea2Q9QVN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcea2Q9QVN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms