Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole3Q9JKP7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole3Q9JKP7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms