Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trem1Q9JKE2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trem1Q9JKE2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trem1Q9JKE2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms