Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Scamp5Q9JKD3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Scamp5Q9JKD3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scamp5Q9JKD3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp5Q9JKD3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms