Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ybx3Q9JKB3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ybx3Q9JKB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ybx3Q9JKB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ybx3Q9JKB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms