Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gfra4Q9JJT2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gfra4Q9JJT2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms