Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn12Q9ET43 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn12Q9ET43 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn12Q9ET43 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms