Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfrsf13bQ9ET35 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms