Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Brd4Q9ESU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Brd4Q9ESU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Brd4Q9ESU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Brd4Q9ESU6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Brd4Q9ESU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms