Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Rb1cc1Q9ESK9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Rb1cc1Q9ESK9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Rb1cc1Q9ESK9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Rb1cc1Q9ESK9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms