Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem27Q9ESG4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem27Q9ESG4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem27Q9ESG4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms