Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ube3bQ9ES34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ube3bQ9ES34 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ube3bQ9ES34 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ube3bQ9ES34 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms