Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sertad3Q9ERC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sertad3Q9ERC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sertad3Q9ERC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sertad3Q9ERC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms