Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trmt112Q9DCG9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trmt112Q9DCG9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trmt112Q9DCG9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trmt112Q9DCG9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms