Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MNCb-2875Q9DCB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms