Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok3Q9DBU3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok3Q9DBU3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms