Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Swt1Q9DBQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Swt1Q9DBQ9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Swt1Q9DBQ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Swt1Q9DBQ9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms