Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ftsj3Q9DBE9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ftsj3Q9DBE9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms