Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SelenooQ9DBC0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SelenooQ9DBC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SelenooQ9DBC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelenooQ9DBC0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelenooQ9DBC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelenooQ9DBC0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SelenooQ9DBC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms