Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tysnd1Q9DBA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tysnd1Q9DBA6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tysnd1Q9DBA6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms