Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Efhc1Q9D9T8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhc1Q9D9T8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efhc1Q9D9T8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms