Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Usp12Q9D9M2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Usp12Q9D9M2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp12Q9D9M2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms