Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ifi35Q9D8C4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ifi35Q9D8C4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi35Q9D8C4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms