Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9D727 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D727 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D727 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D727 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D727 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9D727 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9D727 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9D727 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9D727 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9D727 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D727 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D727 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D727 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D727 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D727 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D727 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D727 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D727 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D727 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D727 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.8 ms