Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc9bQ9D6E4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms