Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc39Q9D5Y1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms