Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnbd2Q9D5U8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnbd2Q9D5U8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnbd2Q9D5U8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms