Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PudpQ9D5U5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PudpQ9D5U5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PudpQ9D5U5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms