Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2al3Q9D4U4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2al3Q9D4U4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms