Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lonrf3Q9D4H7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lonrf3Q9D4H7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms