Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4933414I15RikQ9D4D5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933414I15RikQ9D4D5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933414I15RikQ9D4D5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms