Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
1700034E13RikQ9D2T6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700034E13RikQ9D2T6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700034E13RikQ9D2T6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms