Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tssk3Q9D2E1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tssk3Q9D2E1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tssk3Q9D2E1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms