Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6bQ9D289 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trappc6bQ9D289 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms