Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lingo1Q9D1T0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lingo1Q9D1T0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms