Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem88Q9D0N8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem88Q9D0N8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms