Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfc5Q9D0F6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc5Q9D0F6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc5Q9D0F6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms