Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndc80Q9D0F1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndc80Q9D0F1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndc80Q9D0F1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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