Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Spc24Q9D083 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spc24Q9D083 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spc24Q9D083 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms