Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mdm1Q9D067 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mdm1Q9D067 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms