Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9CYI0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q9CYI0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9CYI0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CYI0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CYI0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms