Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ssu72Q9CY97 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ssu72Q9CY97 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ssu72Q9CY97 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms