Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Bud23Q9CY21 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bud23Q9CY21 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bud23Q9CY21 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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