Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxxc1Q9CWW7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxxc1Q9CWW7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxxc1Q9CWW7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms